Изомеры состоят из одних и тех же атомов, но уложены в пространстве по-разному. Иногда эта разница решает, жидкое вещество или твердое, лекарство или яд.
Вокруг одинарной связи C−C части молекулы свободно вертятся, как колеса на оси. Разные положения при таком вращении называют конформациями. Они превращаются друг в друга миллиарды раз в секунду, поэтому разделить их нельзя. Двойная связь C=C устроена иначе: ее вторая часть, π-связь, держит атомы в одной плоскости и не дает им повернуться. Если две группы стоят по одну сторону двойной связи, это цис-изомер, если по разные, транс-изомер. Это уже разные вещества со своими температурами плавления.
Третий случай самый хитрый. Атом углерода с четырьмя разными соседями дает две молекулы, которые относятся друг к другу как левая и правая перчатка. Они зеркальные, но никаким поворотом их не совместить. Такие молекулы называют хиральными. По температурам кипения их не отличить, а вот поляризованный свет одна поворачивает вправо, а другая влево. Клетки живого организма тоже их различают.